nchgr ініціює послідовність пілотних проектів

NIH Національного Центру дослідження геному людини (NCHGR) нещодавно оголосила експериментальне дослідження з метою вивчити можливість великомасштабного секвенування ДНК людини. Ця ініціатива, яка в бюджеті в $ 60 млн протягом 3 років, включає в себе шість американських науково-дослідних центрів і, за прогнозами виробляють послідовність близько 3% ДНК людини в перші 2 роки.

Пілотне дослідження призначене, щоб показати чи великомасштабного секвенування може бути зроблено швидко, точно і економічно ефективного використання існуючих стратегій і варіації. Груп, що беруть участь в пілотному проекті буде прагнути до помилки розмірі не більше 1 10 000 баз, або 99,99% точністю, в усіх регіонах геному. Найближчим завданням є уточнення стратегії, необхідні для визначення порядку 3000000000 баз в геномі, аналізувати інформацію, і представити його до решти в галузі біомедицини дослідження.

Головні дослідники, перші рік-грантів, та індивідуальних цілей проекту слідувати.

Марк Адамс (Інституту геномних досліджень): Послідовність ДНК людини на хромосомі 16 короткого плеча, створення бібліотек ДНК і розробкою програмного забезпечення для зразка стеження, управління даними і автоматизації збирання послідовності даних.

Річард А. Гіббс (Бейлор медичний коледж): Дослідіть структури Х-хромосоми регіонах з високої і низької щільності генів і протестувати нову стратегію щодо скорочення кількості реакцій секвенування, необхідних для завершення області ДНК з високою точністю.

Ерік Ландер (Уайтхед Інститут медико-біологічних досліджень): Розробка експортований роботизована система, управляється відносно невелика команда, з можливістю послідовності ДНК людини швидко, точно і з мінімальними витратами; зосередивши на хромосомах 9 і 17, розробка автоматизації перетворення фізичної картки на картку потрібно для секвенування.

Річард Майєрс (Стенфордський університет): Перевірте спрямована стратегія, яка вимагає великих попередніх карт, однак менш складних обчислень в області послідовності хромосом 4 і 21, у співпраці з промисловими партнерами, розвивати ферменти для поліпшення авансові картування і ДНК-чіпи для перевірки послідовності.

Мейнард Олсон (Університет штату Вашингтон, Сіетл): Нанесіть критичних технологій, визначених групою секвенування регіонах хромосоми 7. У додатковий проект паралельної підтримки Міністерства енергетики, групи Олсона розробить додаткові технології і буде послідовно регіонами інших хромосом.

Роберт Уотерстон (Університет Вашингтона, Сент-Луїс): Послідовність 60 до 100 Mb хромосом людини 7, 22 і X; випробування модульної структури управління для великомасштабного секвенування геному. Співпрацювати з Сенгер центр для підвищення продуктивності шляхом поліпшення механізації, підвищення ступеня автоматизації, а також створення нового програмного забезпечення, а також знизити витрати при збереженні високої точності.