очі на приз доставити послідовності

Послання від Арі Патрінос в листопаді минулого року на шостому DOE геномі програми Підрядник-грантоотримувачів зустрічі в Санта-Фе був ясним і недвозначним: Проект геному людини повинно залишатися зосередженим на зобов’язання для отримання високої точності, повноти людської послідовності ДНК до 2005 року . Більше 400 Геном грантоотримувачів програми, менеджери та гості взяли участь у семінарі в місті “свята віра”, високо над південно-західною пустелі.

Патрінос, заступник директора Управління Міністерства енергетики біологічних і екологічних досліджень (OBER), пояснив причини різкого збільшення підтримки великомасштабних секвенування за рахунок інших проектів в геномі програми. Це просто, сказав він. “Нам потрібно, щоб взяти наші цілі людського геному серйозно, або державна підтримка може випаруватися і принести потенційно серйозні бюджетні наслідки.”

Рішення для Ober, Патрінос продовжував, спрямовані саме на заставу МЕ пройти як мінімум 5 хромосом людини, 16 і 19 (близько 340 Мб або 10% геному) протягом наступних 7 років. Потім він коротко виклав кроки DOE приймає до свого важке завдання.

секвенування завод по доріжці
DOE зробив перше і найважливіше зміна в своєму геномі програми в кінці 1996 року, приєднавшись секвенування генома центр роботи в Ліверморської національної лабораторії (LLNL), Національної лабораторії Лоренса Берклі (LBNL) і Лос-Аламоської національної лабораторії в Спільної інституту генома (JGI ). Цей крок спрямований на експлуатацію індивідуальні сильні, скорочення надмірності, а також створення критичної маси, необхідної.

“Єдиний спосіб зробити Виробництво послідовності від запланованого масштабу конкурентоспроможною з фабрикою підхід”, Патрінос стверджував. Робота на новому виробництві в JGI Секвенування фонду (НПФ) почалася в січні в Walnut Creek, штат Каліфорнія, приблизно в 35 хвилинах від Ліверморської лабораторії та лабораторії Берклі.

З PSF операцій планується почати в кінці осені 1998 року, Патрінос сказав, що йому “дуже оптимістично”. Він довіряв важку роботу і сильну підтримку основних вчених, вище керівництво в трьох лабораторіях, DOE і радників, багато з яких були на засіданні.

Послідовність якості породжених JGI буде відповідати або перевершувати стандарти спільноти і включають в себе повну та оперативну інформацію релізі. JGI буде проведений за найвищими стандартами забезпечення якості та управління базою даних і обміну ними. Очікування для сильної академічної співпраця з центрами секвенування фінансуються у рамках NIH Національного геномі науково-дослідного інституту, Патрінос сказав.

Інформатика та технології розвитку
Ефективна програма технології та інформатики має важливе значення для успіху у виробництві секвенування Патрінос тривали. Він також підкреслив важливість координації зусиль підвищеної інформатики не тільки в рамках програми, але і з НИЗ і Національний науковий фонд. “Це дуже важливо”, сказав він, “для боротьби з 3000000000 BP ДНК людини і на пост-проекту виклики, які стоять перед нами в розумінні біології з довгих ланцюжків послідовності, нове поле функціональна геноміка». (Див. Нові нагороди, і дані від перенапруги.)

Підготовка до майбутнього
Патрінос висловив тверде переконання, що програма Геном людини МЕ є важливим для майбутнього біології, науки і суспільства і що вона вимагає участі багатьох дисциплін, щоб принести свої обіцянки в життя. Він вказав на 50-річну традицію біологічних і екологічних досліджень Програми підтримки різноманітним портфелем досліджень, який спонукає науку в дисциплінарної інтерфейсів, де відбуваються самі аванси. “Міністерство енергетики зробило свою справу з навчанням фізиків, інженерів та комп’ютерних фахівців для зміцнення програми таким чином, що може допомогти нам досягти цілей проекту генома, а також створення інших програм,” сказав Патрінос.